Het belangrijkste verschil tussen chromosoombanding en chromosoomschildering is dat chromosoombanding een kleuringstechniek is die gebieden van chromosomen weergeeft in te onderscheiden donkere en lichte banden, maar chromosoomschilderen is een hybridisatietechniek waarbij specifieke gebieden of segmenten van chromosomen worden geverfd met sequentiespecifiek fluorescent gelabelde sondes.
In de cytogenetica is het noodzakelijk om een zichtbaar karyotype van een organisme te produceren om chromosomen en hun afwijkingen te identificeren. Chromosoombanding en chromosome painting zijn twee cytogenetische technieken die helpen bij het visualiseren van chromosomen. Beide technieken zijn nuttig bij het identificeren van genetische aandoeningen.