Het belangrijkste verschil tussen prostaglandinen en leukotriënen is dat prostaglandinen worden geproduceerd door alle celtypen en alle delen van het lichaam die te maken hebben met letsel en ziekte, terwijl leukotriënen worden geproduceerd door leukocyten.
Eicosanoïden zijn een familie van bioactieve lipidenmediatoren. Het zijn zuurstofrijke vetzuren met 20 koolstofatomen die worden gesynthetiseerd uit essentiële vetzuren in de voeding. Ze nemen deel aan de regulering van een reeks fysiologische en pathologische reacties. Bovendien vertonen ze krachtige inflammatoire eigenschappen en helpen ze bij de ontwikkeling en regulering van immunologische en inflammatoire reacties. Prostaglandinen en leukotriënen zijn twee soorten eicosanoïden die zijn afgeleid van arachidonzuur. Prostaglandinen versterken de vasculaire permeabiliteitseffecten van histamine en bradykinine, terwijl leukotriënen de accumulatie van leukocyten tijdens acute ontsteking mediëren.