Het belangrijkste verschil tussen Harris en Mayer's hematoxyline is dat Harris hematoxyline wordt gebruikt bij regressieve kleuring, terwijl Mayer's hematoxyline wordt gebruikt bij progressieve kleuring.
Hematoxyline is een basiskleurstof die veel wordt gebruikt in de histopathologie. Het is een natuurlijke kleurstof die wordt gewonnen uit de boom Haematoxylon campechianum. Het is een donkerblauwe of paarse kleurstof. Met hematoxyline kunnen microscopisch kleine nucleaire details van cellulaire en weefselcomponenten worden aangetoond. Deze kleurstof is positief geladen en bindt zich daarom met negatief geladen stoffen zoals DNA en RNA en kleurt ze in violette kleur. Hematoxyline heeft een bijtmiddel nodig om de verbinding met de weefselcomponenten te bevorderen. Een bijtmiddel is een chemische stof, in het bijzonder een zout van aluminium, ijzer, wolfraam, dat de binding van een kleurstof aan de weefselcomponent vergemakkelijkt.
Op basis van de beitsmiddelen die ze bevatten, zijn er verschillende soorten hematoxyline beschikbaar. Sommigen van hen zijn Ehrlich's, Mayer's, Harris ', Gill's, Delafield's, Cole's en Carazzi's hematoxyline. Zowel de hemoxyline-formuleringen van Harris als Mayer zijn bijtende hematoxyline op basis van aluminium.