De belangrijk verschil tussen esterase en lipase is dat het esterase een enzym is dat in water oplosbare korte acylketenesters hydrolyseert, terwijl het lipase een enzym is dat in water onoplosbare triacylglycerolen met lange keten hydrolyseert.
Hydrolasen zijn enzymen die in wezen de hydrolyse van organische verbindingen katalyseren. Op het gebied van lipiden en vetvertering en hydrolyse zijn er twee hoofdtypen hydrolasen. Het zijn esterasen en lipasen. Esterase is een enzym dat de hydrolyse van esterverbindingen katalyseert. Ter vergelijking: lipase behoort tot een subset van esterase. Het katalyseert de hydrolyse van lipiden, vooral tijdens de spijsvertering. Esterasen zijn in water oplosbare stoffen, terwijl lipasen niet in water oplosbaar zijn en sterk aggregeren in water.