Een van de belangrijkste verschillen tussen histologie en cytologie is dat histologie een tak van biologie is die onderzoek doet naar weefsels van dieren en planten onder de microscoop, terwijl cytologie een andere tak van biologie is die cellen onder de microscoop bestudeert. Bovendien zijn histologische studies breder, gedetailleerder en duurder dan cytologische studies.
Elk levend organisme op aarde bestaat uit een cel of een verzameling cellen behalve virussen. De cel is de kleinste structurele en functionele eenheid van een organisme. Een weefsel is een groep cellen die een gemeenschappelijke functie vervullen en een vergelijkbare oorsprong hebben. Verschillende soorten weefsels werken samen en vormen een orgaan. Een orgaansysteem is een verzameling orgels. Evenzo omvat het dierlijke of plantaardige lichaam verschillende niveaus van organisaties met de toenemende complexiteit van elk niveau, van cellen tot orgaansystemen tot organismen. Daarom hebben eencellige organismen eenvoudige structuren, terwijl de meeste meercellige organismen zeer complexe structuren hebben. Histologie en cytologie zijn twee takken van de biologie die de weefsels van dieren en planten en cellen microscopisch bestuderen.
