Het belangrijkste verschil tussen histopathologie en cytologie is dat histopathologie de studie is van zieke weefsels met behulp van een microscoop, terwijl cytologie de studie is van individuele cellen van het lichaam.
Cellen zijn de structurele basiseenheden van het leven. Tijdens de diagnose van ziekten in de geneeskunde worden cellen en hele weefsels door pathologen onderzocht. De studie van weefsels in relatie tot ziekte staat bekend als histopathologie. Daarentegen staat de studie van een enkel celtype bekend als cytologie. Daarom kijkt histopathologie naar weefsels terwijl cytologie naar individuele cellen kijkt.
