De belangrijk verschil tussen dikaryon en heterokaryon is dat dikaryon verwijst naar een schimmelcel die precies twee genetisch verschillende kernen bevat binnen hetzelfde cytoplasma, terwijl heterokaryon verwijst naar een cel die twee of meer genetisch verschillende kernen bevat in een gemeenschappelijk cytoplasma.
Plasmogamie en karyogamie zijn twee processen van seksuele voortplanting. Over het algemeen treedt plasmogamie op vóór karyogamie. Tijdens plasmogamie versmelten celmembranen van de twee parende type cellen met elkaar tot een gemeenschappelijke cel. Tijdens karyogamie versmelten twee genetisch verschillende kernen met elkaar. Soms volgt karyogamie niet onmiddellijk op plasmogamie. Op dat moment bestaan er twee of meer kernen in een gemeenschappelijk cytoplasma. Dikaryon en heterokaryon zijn twee van dergelijke staten.