De belangrijk verschil tussen homozygoot en heterozygoot is dat homozygoot betekent dat beide allelen vergelijkbaar zijn voor een eigenschap, terwijl heterozygoot betekent dat de twee allelen verschillend zijn voor een eigenschap.
De genen die zijn geërfd van de ouderchromosomen beheersen alle karakters of eigenschappen van dieren, planten en alle andere levende wezens. Het is de belangrijkste reden voor het vertonen van ouderlijke kenmerken in het nageslacht. De meeste eukaryote organismen hebben twee sets genen die bekend staan als maternale genen en vaderlijke genen. Daarom staat de genetische situatie bekend als diploïde (twee sets chromosomen). Dat betekent; alle eigenschappen hebben genetische componenten van zowel moeder als vader. Deze genen kunnen echter dominant of recessief zijn over elkaar en dat is waar homozygote en heterozygote kenmerken belangrijk worden. Homozygoot is een toestand met twee dominante allelen (AA) of twee recessieve allelen (aa), terwijl heterozygoot een toestand is met één dominant allel en één recessief allel (Aa).