Het belangrijkste verschil tussen tardieve dyskinesie en dystonie is dat de tardieve dyskinesie altijd ondergeschikt is aan langdurig gebruik van neuroleptica, maar dystonie kan te wijten zijn aan verschillende andere oorzaken. Verder is dystonie de abnormale spierspanning die resulteert in spierspasmen of abnormale houdingen. Terwijl tardieve dyskinesie verwijst naar oncontroleerbare mond- en lip-smakende grimassen die ontstaan na langdurig gebruik van neuroleptica.
Beide aandoeningen zijn abnormale bewegingsstoornissen; dystonieën omvatten een verscheidenheid aan bewegingsstoornissen die om verschillende redenen optreden, terwijl tardieve dyskinesie slechts een subgroep van primaire dystonieën is.
