Het belangrijkste verschil tussen pluripotente en geïnduceerde pluripotente stamcellen is dat de pluripotente cellen ongedifferentieerde moedercellen zijn (van embryo's, enz.), Die het natuurlijke vermogen hebben om te differentiëren in verschillende celtypen, terwijl de geïnduceerde pluripotente stamcellen somatische volwassen cellen zijn die hebben genetisch geherprogrammeerd om kenmerken te vertonen die vergelijkbaar zijn met natuurlijke pluripotente stamcellen.
Een stamcel is een ongedifferentieerde cel die het unieke vermogen heeft zich te ontwikkelen tot verschillende of gespecialiseerde cellen. Bovendien zijn er drie soorten stamcellen, namelijk unipotent, pluripotent en multipotent. Als een stamcel kan differentiëren in één, meerdere en in alle celtypen, staat deze bekend als respectievelijk unipotente, multipotente of pluripotente stamcel. Van de drie bovengenoemde typen zijn pluripotente stamcellen belangrijk omdat ze kunnen differentiëren in alle celtypen. Een pluripotente embryonale stamcel kan zich ontwikkelen tot een heel mens.
