De belangrijk verschil tussen allel en genotype is dat het allel een van de variantvormen is van een gen dat zich op dezelfde genetische locus van een chromosoom bevindt, terwijl het genotype de genetische samenstelling van een bepaald kenmerk is.
Genetica is de studie van genen en erfelijke patronen in organismen. Chromosomen zijn de structuren die de genetische informatie van een organisme bevatten. Daarom is er in eukaryoten een specifiek aantal chromosomen aanwezig in het genoom. Elk chromosoom heeft duizenden genen die specifieke regio's van de chromosomen zijn. In feite zijn genen structurele eenheden in de genetica die genetische informatie opslaan om eiwitten te produceren. Elk gen heeft twee kopieën die afstammen van elke ouder.
Evenzo is een allel een variant van een gen of vorm van een gen. Bovendien heeft elk gen twee vormen van allelen die het kenmerk bepalen dat door het gen wordt gecodeerd. Genotype is dus de genetische samenstelling van een organisme die wordt bepaald door de verdeling van allelen in verschillende genen.
