Het belangrijkste verschil tussen diapsid en synapsid is dat diapsid een gewerveld dier is dat twee grote gaten bezit die bekend staan als temporale fenestrae in hun schedel, terwijl synapsid een gewerveld dier is dat slechts één gat in elke kant van hun schedel rond het slaapbeen heeft.
Diapsids en synapsids zijn twee groepen van de amniotische clade die chordaten bevatten. Amnioten hebben een tijdelijk gebied in de schedel dat solide kan zijn of openingen kan hebben. De belangrijkste tussen diapsid en synapsid is het aantal openingen of gaten (temporale fenestrae) in de schedel achter elk oog. Diapsid heeft twee tijdelijke fenestrae in de schedel, terwijl synapsid één tijdelijke fenestra in de schedel achter elk oog heeft. De meeste reptielen en alle vogels zijn diapsids, terwijl de meeste zoogdieren synapsids zijn.
