Het belangrijkste verschil tussen genamplificatie en genklonering is dat de genamplificatie het proces is waarbij in vitro veel kopieën worden gemaakt van het gen van belang door een polymerasekettingreactie. Maar het klonen van genen is een proces waarbij in vivo veel kopieën van het gen van belang worden gemaakt door een recombinant plasmide te maken en dit in een gastheerbacterie te transformeren.
Een gen is een specifiek fragment van DNA dat codeert voor een eiwit. Een organisme heeft duizenden genen. Bovendien is het mogelijk om de DNA-sequenties van belangrijke genen te vermenigvuldigen met behulp van moleculair biologische technieken. Genamplificatie en genklonering zijn twee van dergelijke procedures. Beide procedures produceren veel kopieën van een interessant gen. Er is echter een verschil tussen genamplificatie en genklonering in termen van hun methodologie.
