Het belangrijkste verschil tussen eclips en latente periode is dat de eclipsperiode de tijd is van het synthetiseren van faageiwitten en nucleïnezuren in de gastheercel, terwijl de latente periode de tijd is tussen injectie van het virale genoom in de cel en de lysis van de gastheercel.
Een bacteriofaag (faag) is een obligaat intracellulair virusdeeltje dat infecteert en zich voortplant binnen een specifieke bacterie. Deze zijn ook bekend als bacterie-eters omdat ze fungeren als bacteriedodende middelen. De complexe vorm van kop en staart is de meest voorkomende vorm die wordt getoond door bacteriofagen. Ze infecteren de gastheerbacteriën om zich voort te planten. Aan het begin van de infectie hechten ze zich stevig vast aan de bacteriële celwand met behulp van hun oppervlaktereceptoren en injecteren ze hun genetisch materiaal in de gastheercel. Dan kan hun infectie plaatsvinden via twee cycli: lytische en lysogene cyclus.
In de lytische cyclus infecteren bacteriofagen bacteriën en doden ze snel de bacteriële gastheercel door lysis. In de lysogene cyclus integreert viraal genetisch materiaal met bacterieel genoom of plasmiden en bestaat het gedurende vele generaties in de gastheercel zonder de gastheerbacterie te doden. Het infectieproces volgt verschillende perioden, zoals de latente periode, de eclipsperiode, de stijgingsperiode, enz.