Het belangrijkste verschil tussen alfa- en bèta-anomeren is dat in alfa-anomeer de hydroxylgroep op de anomere koolstof cis is voor de exocyclische zuurstof in het anomere centrum, terwijl in bèta-anomeer de hydroxylgroep trans is naar de exocyclische zuurstof.
Een anomeer is een geometrische variatie tussen koolhydraten. Het is een soort epimeer waarin we een anomeer koolstofatoom kunnen zien. Een anomeer koolstofatoom is afgeleid van de carbonylkoolstof van de open-ketenstructuur van het koolhydraat. Daarom wordt de vorming van de cyclische structuur uit de open-ketenstructuur anomerisatie genoemd.
