Het belangrijkste verschil tussen Klenow-fragment en DNA-polymerase 1 is dat Klenow-fragment een groot deel van DNA-polymerase 1 is dat 5 ′ tot 3 ′ exonuclease-activiteit mist, terwijl DNA-polymerase een enzym is van E. coli dat alle drie de domeinen heeft, waaronder 5 ′ tot 3 'exonuclease-activiteit.
DNA-polymerase is een van de sleutelenzymen die betrokken zijn bij DNA-replicatie in levende organismen. Er zijn verschillende vormen van DNA-polymerase-enzym gevonden in eukaryoten en prokaryoten op basis van de grootte en vorm. DNA-polymerase 1, 2 en 3 worden alleen aangetroffen in prokaryote organismen en ze spelen verschillende rollen bij DNA-replicatie. DNA-polymerase 1 heeft drie domeinen met 5 ′ tot 3 ′ polymerase, 3 ′ tot 5 ′ exonuclease-activiteit en 5 ′ tot 3 ′ exonuclease-activiteit. Klenow-fragment is een proteolytisch product van DNA-polymerase 1. Het bezit 5 tot 3 ′ polymerase en 3 ′ tot 5 ′ exonuclease-activiteiten van intact DNA-polymerase 1, maar het mist de 5 ′ tot 3 ′ exonuclease-activiteit.