Het belangrijkste verschil tussen coliformen en Enterobacteriaceae is dat de coliformen een groep gram-negatieve, staafvormige en lactose-fermenterende bacteriën zijn, terwijl Enterobacteriaceae een grote familie van gram-negatieve bacteriën is.
Indicatororganismen zijn de organismen die als tekens dienen om een bepaalde situatie aan te duiden. Ze duiden op de aanwezigheid van iets dat niet normaal is. Coliformen en Enterobacteriaceae zijn indicatorbacteriën die het teken van de hygiënische kwaliteit van voedsel en water aangeven en ook de omstandigheden van het milieu aangeven. Bovendien behoren alle coliformen tot Enterobacteriaceae, maar alle leden van Enterobacteriaceae zijn geen coliformen.