De belangrijk verschil tussen substraat en actieve site is dat het substraat een chemische verbinding is die een chemische reactie kan ondergaan, terwijl de actieve site een specifiek gebied op een enzym is.
Enzymen zijn biologische katalysatoren. Dit zijn eiwitten die de activeringsenergie van een chemische reactie kunnen verminderen om de energiebarrière van die reactie te verkleinen. Daarom kan het de reactiesnelheid verhogen. De reactant van de reactie waarbij enzymen betrokken zijn, is het "substraat". Dit substraat bindt zich met de actieve plaats van het enzym. Daar vinden de reacties plaats. Uiteindelijk komen de producten van de reactie vrij.
