Het belangrijkste verschil tussen chromosoom en chromatide is dat een chromosoom een lange draadachtige vorm is van een DNA-molecuul, terwijl een chromatide de helft is van twee identieke kopieën van een gerepliceerd chromosoom. In feite zijn twee chromatiden met elkaar verbonden door een centromeer om een chromosoom te vormen.
Chromosoom en chromatide zijn nauw verwante structuren die zijn gemaakt van DNA-moleculen. Chromosomen bevatten genetische informatie in de vorm van specifieke DNA-sequenties of genen. Een enkele DNA-streng wordt een chromosoom genoemd en twee chromatiden vormen een enkel chromosoom. Chromosomen zijn vectoren of vervoeren van genetische materialen van het ene organisme naar het andere, terwijl chromatiden deze cellen in staat stellen zich te dupliceren.