Het belangrijkste verschil tussen polytene en lampbrush chromosoom is dat de polytene chromosoom is een reus, zes bewapend en gestreepte chromosoom aanwezig in veel dipteron vliegensoorten terwijl lampbrush chromosoom is een gigantische chromosoom aanwezig in eicellen van gewervelde dieren die hebben een verschijning van een lampbrush.
Een chromosoom verwijst naar een draadachtige structuur die is samengesteld uit stevig verpakte DNA-moleculen en histoneiwitten. Het heeft ook een typische vorm en een gemiddelde grootte. Er zijn echter chromosomen van extreem grote afmetingen aanwezig in sommige dierlijke cellen. Structureel zijn het gigantische chromosomen. Onder deze gigantische chromosomen zijn polytene en lampbrush-chromosoom twee voorbeelden.