Het belangrijkste verschil tussen cyclohexaan en cyclohexeen is dat het cyclohexaan een verzadigde koolwaterstof is, terwijl het cyclohexeen een onverzadigde koolwaterstof is.
Er zijn verschillende soorten organische verbindingen gemaakt door verschillende elementen met koolstofatomen te verbinden. Cyclohexaan en cyclohexeen zijn koolwaterstoffen die alleen uit koolstof- en waterstofatomen bestaan. Koolwaterstoffen zijn in twee vormen: aromatische en alifatische koolwaterstoffen. Bovendien kunnen we ze categoriseren als verzadigde (alkanen) en onverzadigde (alkenen en alkynen) koolwaterstoffen. Alle bindingen tussen koolstofatomen en waterstofatomen zijn enkele bindingen in verzadigde koolwaterstoffen, terwijl er dubbele of drievoudige bindingen zijn tussen de koolstofatomen in onverzadigde vormen.