Het belangrijkste verschil tussen flora en fauna is dat de flora verwijst naar het plantenleven in een bepaalde regio, terwijl de fauna verwijst naar het dierenleven in een bepaalde regio.
Flora en fauna zijn twee algemene termen die worden gebruikt om respectievelijk naar planten en dieren in een bepaalde regio te verwijzen. Omdat flora alle planten vertegenwoordigt, kunnen we zeggen dat flora alle immobiele autotrofe fotosynthetische organismen omvat. Evenzo kunnen we zeggen dat fauna alle mobiele heterotrofe organismen omvat die voor voedselbronnen van anderen afhankelijk zijn. Daarom worden deze woorden flora en fauna meestal samen gebruikt om het planten- en dierenleven in een regio of gebied te beschrijven. Zowel de flora als de fauna van een bepaalde plaats zijn om een aantal redenen belangrijk, vooral om ecologische redenen. Zowel planten als dieren die inheems zijn in een bepaalde plaats, handhaven het ecologische evenwicht en wetenschappers houden alle soorten bij om te zien of een van deze soorten met uitsterven wordt bedreigd. Wetenschappers en milieuactivisten werken vervolgens nauw samen om methoden te bedenken om dit delicate ecologische evenwicht te herstellen.