De belangrijk verschil tussen muonen en mesonen is dat muonen een soort elementaire deeltjes zijn die geen onderstructuur hebben, terwijl mesonen een soort hadronische subatomaire deeltjes zijn met een paar quark- en anti-quarkdeeltjes.
Muonen en mesonen zijn twee soorten deeltjes in materie. Muonen zijn een soort elementaire deeltjes zoals elektronen, en we kunnen ze niet verder verdelen in kleinere structuren (zoals quarks). Maar mesonen zijn iets groter dan muonen en bevatten quark- en antiquark-deeltjes; dus vallen ze onder een andere categorie, hadronische subatomaire deeltjes genaamd. De term hadronisch betekent dat het twee of meer quarkdeeltjes bevat, en subatomaire deeltjes zijn kleinere structuren dan toms, die de structuur van een atoom opbouwen.
