Het belangrijkste verschil tussen genmapping en gensequencing is dat genmapping een techniek is die de locatie van een gen in het genoom en de afstanden tussen genen identificeert, terwijl gensequencing een techniek is die de precieze volgorde van nucleotiden van een gen identificeert.
Genmapping en gensequencing zijn belangrijk bij genetische diagnostiek om de aanwezigheid van genen te lokaliseren en te bevestigen. Moleculaire technieken zoals gelelektroforese en polymerasekettingreactie spelen dus een belangrijke rol bij het afleiden van een genkaart. Bovendien is het gebruik van verschillende sequentietechnieken zoals Sanger-sequencing en Next-Generation-sequencing essentieel om een gensequentie te genereren.
