Het belangrijkste verschil tussen positieve en negatieve ionisatie in massaspectrometrie is dat de positieve ionisatie positief geladen ionen vormt, terwijl de negatieve ionisatie negatief geladen ionen vormt.
Massaspectrometrie of MS is een techniek in de analytische chemie die de massa-tot-ladingverhouding van ionen meet. Het eindresultaat van deze techniek komt als een massaspectrum dat verschijnt als een plot van intensiteit. Verder wordt deze grafiek getekend als een functie van de massa-tot-ladingverhouding. Voor massaspectrometrie is het instrument dat we gebruiken een massaspectrometer. Wanneer we ons monster in dit instrument introduceren, ondergaan monstermoleculen ionisatie. Hierbij is het kiezen van de juiste ionisatietechniek erg belangrijk omdat dit een grote impact heeft op het eindresultaat. Als we een reagensgas gebruiken, bijv. Ammoniak, zal het ionisatie van monstermoleculen veroorzaken om ofwel alleen positieve ionen of alleen negatieve ionen te vormen, afhankelijk van de opstelling van het instrument.
