Het belangrijkste verschil tussen cytochroom en fytochroom is dat cytochroom een elektronenoverdracht heem-eiwit is dat betrokken is bij aërobe ademhaling. Ondertussen is fytochroom een fotoreceptor-eiwit dat gevoelig is voor rood en verrood licht van het zichtbare spectrum.
Levende organismen hebben verschillende soorten pigmenten. Sommige zijn lichtabsorberende pigmenten, andere zijn ademhalingspigmenten. Cytochroom is een metalloproteïne dat werkt als een elektronendrager bij aërobe ademhaling. Ondertussen is fytochroom een fotoreceptor die rood en verrood licht uit het zichtbare spectrum absorbeert. In vergelijking met cytochroom zijn fytochromen belangrijk in veel aspecten van de ontwikkeling van planten.
