Het belangrijkste verschil tussen oligopeptide en polypeptide is dat oligopeptiden weinig aminozuurresiduen bevatten, terwijl polypeptiden een groot aantal aminozuurresiduen bevatten.
De termen oligopeptiden en polypeptiden vallen onder de categorie eiwitten. Peptiden zijn korte ketens van aminozuren. Aminozuren binden met elkaar via peptidebindingen. Daarom kunnen we deze peptiden categoriseren op basis van het aantal aminozuren dat in deze peptiden aanwezig is. Bijv. Dipeptiden, tripeptiden, tetrapeptiden, oligopeptiden en polypeptiden.