De belangrijk verschil tussen archenteron en blastocoel is dat archenteron de primaire darm is die wordt gevormd tijdens gastrulatie in de zich ontwikkelende zygote, die zich later ontwikkelt tot de spijsverteringsbuis, terwijl blastocoel een inwendige met vloeistof gevulde of met dooier gevulde holte van de blastula is die wordt gevormd tijdens blastulatie.
Bemesting is het geval van seksuele voortplanting die een diploïde zygote vormt. De zygote verandert uiteindelijk in een embryo. Het embryo ondergaat mitotische delingen en celdifferentiatie, waardoor een meercellig embryo ontstaat. Morula is een vroeg stadium van het embryo, dat 16 cellen bevat. Morula wordt de blastula bij de zevende splitsing. Blastula bevat 128 cellen. Het is een holle bol van cellen die een met vloeistof gevulde binnenholte omgeeft. En deze met vloeistof gevulde holte van blastula staat bekend als blastocoel. Blastula vouwt naar binnen en vergroot om gastrula te maken, een meerlagige structuur met primaire kiemlagen. Archenteron is de primaire darm in de gastrula. Archenteron ontwikkelt zich later tot de spijsverteringsbuis.
