Het belangrijkste verschil tussen Azotobacter en Azospirillum is dat Azotobacter een geslacht is van bacteriën die voornamelijk aërobe en endofytische diazotrofen zijn. Ondertussen is Azospirillum een geslacht van plantengroei-bevorderende bacteriën die micro-aerofiele en oppervlakte-koloniserende bacteriën zijn.
Azotobacter en Azospirillum zijn twee bacteriegeslachten die belangrijk zijn als stikstofbindende middelen in de bodem. Het zijn voornamelijk bodembacteriën die gramnegatief zijn. Bovendien zijn het vrijlevende bacteriën die plantenwortels associëren. Ze bevorderen de groei en ontwikkeling van planten na inenting. Azotobacter spp zijn heterotrofe en aërobe, ovale of bolvormige bacteriën, terwijl Azospirillum spp microaerofiele en niet-fermentatieve staafvormige bacteriën zijn.