Het belangrijkste verschil tussen geconserveerde en consensussequentie is dat geconserveerde sequentie verwijst naar vergelijkbare sequenties van nucleïnezuren of aminozuren die gedurende generaties in verschillende of dezelfde soorten voorkomen, terwijl consensussequentie een veel voorkomende nucleotidensequentie of aminozuursequentie is die wordt aangetroffen in een sterk geconserveerd gebied van DNA of RNA of eiwit.
Organismen hebben zowel vergelijkbare als verschillende kenmerken. Bij het bestuderen van de relaties tussen organismen en het classificeren ervan, is het genoom of de genetische samenstelling van organismen erg belangrijk. Er zijn enkele nucleotide- of aminozuursequenties die veel voorkomen bij verschillende organismen. Een geconserveerde sequentie is een nucleïnezuur- of aminozuursequentie die consistent is tussen soorten. Daarom zijn ze fylogenetisch belangrijk bij het genereren van fylogenetische bomen. In geconserveerde sequenties zijn er specifieke nucleotidesequenties die vaker worden aangetroffen. Ze staan bekend als consensussequenties.
