Het belangrijkste verschil tussen holandrisch en geslachtsgebonden gen is dat holandrisch gen een vorm van geslachtsgebonden gen is dat zich op het Y-chromosoom bevindt, terwijl geslachtsgebonden gen een gen is dat zich op geslachtschromosomen bevindt.
Een paar geslachtschromosomen kan het geslacht van mensen en andere zoogdieren bepalen. Mannetjes hebben XY-chromosomen, terwijl vrouwtjes XX-chromosomen hebben. X- en Y-chromosomen zijn niet homoloog. Ze hebben ook niet dezelfde genen. Y-chromosoom is korter en bevat een klein aantal genen in vergelijking met het X-chromosoom. De genen op het X-chromosoom staan bekend als X-gekoppelde genen. Evenzo staan de genen op het Y-chromosoom bekend als Y-gekoppelde genen of holandrische genen. Zowel X-gekoppelde als Y-gekoppelde genen zijn algemeen bekend als geslachtsgebonden genen.