Het belangrijkste verschil tussen genocopie en fenocopie is dat in genocopieën fenotypes gelijkenis vertonen en het genotype verandert, terwijl bij fenocopie de fenotypes variëren en het genotype ongewijzigd blijft.
De ongelijkheid tussen genocopie en fenocopie is betrokken bij het verklaren van de zeldzame gevallen van genetica. De twee concepten laten zien hoe traditionele genetica of Mendeliaanse genetica kunnen variëren op basis van de uitzonderingen in de natuur. Genocopie verwijst naar het fenomeen van het geven van een vergelijkbaar fenotype ondanks een ander genotype. Fenokopie daarentegen verwijst naar het fenomeen van het hebben van verschillende fenotypes ondanks dat het genotype onveranderd blijft.