Het belangrijkste verschil tussen vrij ammoniak en totaal ammoniak is dat de term vrije ammoniak betrekking op het gasvormige NH 3 moleculen, terwijl de term totale ammoniak betreft de som van NH 3 moleculen en ammoniumionen.
Ammoniak is een giftige, gasvormige stof met de chemische formule NH 3. In biologische systemen kan ammoniak in twee soorten voorkomen als geïoniseerde vorm en als verenigde vorm. De geïoniseerde vorm is het ammoniumion met de chemische formule NH 4 +.