De belangrijk verschil tussen het stabiliseren en balanceren van selectie is dat het stabiliseren van selectie een type natuurlijke selectie is dat de voorkeur geeft aan gemiddelde fenotypes in een populatie, terwijl het balanceren van selectie het behoud is van meerdere allelen van een gen binnen een populatie om de genetische diversiteit te verbeteren.
Stabiliserende selectie is een soort natuurlijke selectie die van toepassing is op een fenotypische eigenschap. Het geeft de voorkeur aan gemiddelde fenotypes in een populatie. Daarom elimineert het beide soorten extreme fenotypes. Uiteindelijk zorgt het voor een uniforme bevolking. Balancerende selectie bestaat uit verschillende selectieve processen die een gunstige genetische diversiteit binnen een populatie in stand houden door meerdere allelen van een gen te behouden. Daarom is het van toepassing op een genlocus.
