Het belangrijkste verschil tussen Golgi Bodies en Mitochondria is de functie die ze vervullen. De belangrijkste functie van Golgi-lichamen (of Golgi-apparaat) is de modificatie, sortering en verpakking van eiwitten voor uitscheiding, terwijl de belangrijkste functie van de mitochondriën de productie van energiemunt van de cel (ATP) is door middel van ademhaling.
Eukaryote cellen bevatten cellulaire organellen zoals Golgi-lichaampjes, mitochondriën, lysosomen, ribosomen, celkern enz. Dit zijn vitale organellen die nodig zijn voor de cellulaire functies. Golgi-lichaampjes maken deel uit van het endomembraansysteem dat bestaat uit blaasjes en gevouwen membranen, terwijl Mitochondria dubbele membraangebonden boonvormige organellen zijn die worden aangetroffen in eukaryote cellen.
