Het belangrijkste verschil tussen iso- en neo-structuren is dat het voorvoegsel iso verwijst naar een organische verbinding die alle koolstofatomen bevat behalve één die een continue keten vormt, terwijl het voorvoegsel neo verwijst naar een organische verbinding die alle koolstofatomen bevat behalve twee die een continue keten vormen.
We gebruiken voorvoegsels in de organische chemie om het ene organische molecuul van het andere te onderscheiden. We gebruiken deze voorvoegsels samen met de naam van de verbinding. Omdat deze voorvoegsels specifiek zijn voor verschillende functionele groepen in organische moleculen, kunnen we organische moleculen gemakkelijk identificeren, zelfs als ze nauw verwante chemische structuren hebben.