Het belangrijkste verschil tussen endogene en exogene antigenen is dat het endogene antigeen in de cellen wordt gegenereerd, terwijl het exogene antigeen van buitenaf het lichaam binnenkomt.
Antigeen is een molecuul of een stof die reageert op een product van een specifieke immuunrespons en de vorming van antilichamen stimuleert. Antigeniciteit van dat specifieke molecuul is het vermogen van een antigeen om antilichaamproductie te induceren. Antigenen kunnen ook een eiwit of een polysaccharide zijn. Bovendien bemiddelen antigeenpresenterende cellen (APC's), zoals dendritische cellen, de processen van antigeenopname, antigeenverwerking en antigeenpresentatie. Bovendien kunnen antigenen, afhankelijk van de immuunactiviteit, worden geclassificeerd als immunogenen, tolerogenen of allergenen. Bovendien kunnen we antigenen ook classificeren op basis van hun oorsprong als exogeen of endogeen.
