Het belangrijkste verschil tussen zoogdier en reptiel is dat zoogdier een warmbloedige gewervelde is die de interne lichaamstemperatuur kan reguleren, terwijl een reptiel een koudbloedige gewervelde is die geen constante lichaamstemperatuur kan handhaven.
Gewervelde dieren zijn dieren met een ruggengraat of een wervelkolom. Ze kunnen zowel warmbloedig als koelbloedig zijn. Warmbloedige dieren kunnen de interne temperatuur van het lichaam reguleren, terwijl de koudbloedige dieren geen constante lichaamstemperatuur kunnen regelen. Vandaar dat hun lichaamstemperatuur fluctueert afhankelijk van de buitenomgeving.
Er zijn vijf hoofdgroepen van gewervelde dieren, namelijk vissen, amfibieën, reptielen, vogels en zoogdieren. Onder hen zijn vogels en zoogdieren warmbloedig, terwijl vissen, amfibieën en reptielen koudbloedig zijn. Als we kijken naar de zoogdieren en de reptielen, zijn het beide zuurstofademende gewervelde dieren die voedsel nodig hebben voor de levenden. Beide hebben ook dezelfde orgaancomponenten zoals de hersenen, het hart, de maag, de longen, enz. Bovendien zijn de zoogdieren en reptielen beide tetrapoden, wat betekent dat ze allebei vier ledematen hebben. Hoewel dit enkele overeenkomsten zijn tussen beide, zijn er ook veel verschillen tussen zoogdier en reptiel.