Het belangrijkste verschil tussen eukaryote en prokaryote organismen is dat de eukaryote organismen een echte kern en membraangebonden organellen hebben, terwijl de prokaryote organismen een kern en membraangebonden organellen missen.
Alle levende organismen behoren tot twee categorieën, namelijk prokaryoten of eukaryoten. Prokaryote organismen vertonen een eenvoudige celorganisatie, terwijl eukaryote organismen een complexe celorganisatie vertonen. Bovendien zijn prokaryoten eencellig en missen ze een kern en membraangebonden organellen. Aan de andere kant zijn eukaryoten over het algemeen meercellig en bevatten ze een echte kern en membraangebonden organellen zoals chloroplasten, mitochondriën en endoplasmatisch reticulum, enz. Prokaryoten omvatten bacteriën en archaea, terwijl eukaryoten protisten, schimmels, planten en dieren omvatten. Afgezien van de bovengenoemde verschillen, zijn er meer verschillen tussen prokaryoten en eukaryoten. Daarom is het erg belangrijk om de verschillen tussen prokaryote en eukaryote organismen te begrijpen. Het doel van dit artikel is om het verschil tussen eukaryote en prokaryote organismen te bespreken.