De belangrijk verschil tussen endosymbiose en invaginatie is dat endosymbiose een theorie is die de oorsprong van mitochondriën en chloroplasten in de eukaryote cel verklaart, terwijl de invaginatie een proces is dat de oorsprong van de kern en andere celorganellen verklaart door de vorming van invaginatie uit het plasma. membraan naar het celbinnenland.
Wetenschappers geloven dat eukaryote cellen zijn geëvolueerd uit prokaryote cellen. Ze hebben veel theorieën ontwikkeld om uit te leggen hoe deze evolutie heeft plaatsgevonden. Endosymbiose is zo'n theorie die de oorsprong van mitochondriën en chloroplasten in de eukaryote cellen van de prokaryote bacteriën verklaart. Terwijl invaginatie een proces is dat de oorsprong van de kern en andere membraangebonden organellen in de eukaryote cel verklaart.
