Het belangrijkste verschil tussen mannelijke en vrouwelijke gametofyt hangt af van het type cel dat de twee structuren produceert. Microsporen produceren de mannelijke gametofyt, terwijl macrosporen de vrouwelijke gametofyt produceren.
Mannelijke en vrouwelijke gametofyten komen voort uit hetero-sporen. Ze veroorzaken de seksuele voortplantingscyclus in algen en planten. Deze organismen vertonen echter ook afwisseling van generaties tussen de sporofytische en de gametofytische generatie. Mannelijke en vrouwelijke gametofyten produceren hun respectieve mannelijke en vrouwelijke gameten die nodig zijn voor seksuele voortplanting. Wanneer twee gameten met elkaar versmelten, vormt zich een diploïde cel die bekend staat als zygote en gaat verder in sporofytische generatie.