Het belangrijkste verschil tussen glycogeen en glucose is dat glycogeen een polysaccharide is dat koolhydraten opslaat in dieren en schimmels, terwijl glucose het meest voorkomende monosaccharide is dat werkt als de primaire energiebron in cellen.
Koolhydraten zijn organische verbindingen die worden gekenmerkt door koolstof-, waterstof- en zuurstofelementen. De verhouding tussen waterstof en zuurstof is 2: 1 in koolhydraten, vergelijkbaar met water. Koolhydraten zijn zeer belangrijke wijdverspreide biologische verbindingen omdat ze de belangrijkste energiebron en het structurele bestanddeel van het protoplasma zijn. Over het algemeen zijn koolhydraten wit, vast en oplosbaar in organische vloeistoffen, met uitzondering van bepaalde polysacchariden. Monosacchariden zijn de basiseenheden van koolhydraatmoleculen en glucose is hiervan de belangrijkste. Glycogeen is ook een koolhydraat. Maar het is een polysaccharide gevormd door het anabolisme van glucosemoleculen tot een vertakt molecuul. Zowel glucose als glycogeen zijn belangrijk bij de energieproductie van het lichaam. Glucose is de belangrijkste brandstof voor energieproductie en glycogeen is een soort secundair,energieopslag op lange termijn bij dieren en schimmels.
