Het belangrijkste verschil tussen hybride en gedegenereerde orbitalen is dat hybride orbitalen nieuwe orbitalen zijn die ontstaan door het mengen van twee of meer orbitalen, terwijl gedegenereerde orbitalen oorspronkelijk in een atoom voorkomen.
Zoals de naam al aangeeft, is een hybride orbitaal een hybride van twee of meer orbitalen. Hoewel de naam gedegenereerde orbitaal hetzelfde lijkt, zijn het geen nieuw gevormde orbitalen - ze bestaan al in een atoom. Bovendien hebben alle hybride orbitalen in een molecuul dezelfde energie, terwijl gedegenereerde orbitalen in een atoom dezelfde energie hebben.