Belangrijkste verschil - RNASE A versus RNASE H
De ribonucleasen zijn nucleasen die specifiek RNA afbreken in kleinere eenheden. Ze kunnen worden onderverdeeld in twee categorieën; endoribonucleasen en exoribonucleasen. Endoribonuclease is een endonuclease dat enkelstrengs of dubbelstrengs RNA kan afbreken. Het splitst de fosfodiësterbindingen binnen een RNA-polynucleotideketen. De voorbeelden zijn RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P en RNase H. Exoribonuclease is een exonuclease dat RNA afbreekt door terminale nucleotiden te verwijderen van ofwel het 5'-uiteinde of het 3'-uiteinde van het RNA-molecuul. De voorbeelden zijn RNase R, RNase II, RNase D en RNase PH. Het belangrijkste verschil tussen RNASE A en RNASE H is dat de RNase A een pancreasribonuclease is dat specifiek enkelstrengs RNA afbreekt in kleinere componenten, terwijl RNase H een niet-specifiek enzym is dat het RNA in RNA-DNA-hybride in kleinere eenheden splitst via het hydrolytische mechanisme.
INHOUD
1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat is RNASE A
3. Wat is RNASE H
4. Overeenkomsten tussen RNASE A en RNASE H
5. Vergelijking zij aan zij - RNASE A versus RNASE H in tabelvorm
6. Samenvatting
Wat is RNASE A?
De RNase A is een pancreasribonuclease dat specifiek de ongepaarde cytosine- en uracilresiduen op het 3'-uiteinde van enkelstrengs RNA splitst. RNase H werkt bij een hogere zoutconcentratie (0,3 M of hogere NaCl-concentratie). De hydrolytische reactie bestaat uit twee stappen. Het vormt een 3 'gefosforyleerd product via 2', 3 'cyclisch monofosfaat tussenproduct. Hoewel het specifiek is voor enkelstrengs RNA bij een hogere zoutconcentratie, kan het ook dubbelstrengs RNA en RNA in RNA-DNA-hybride afbreken bij een lagere NaCl-concentratie (lager dan 0,3 M NaCl).
Bruce Merrifield synthetiseerde dit enzym eerst. RNase A is een zeer populair enzym in moleculair onderzoek. RNase A van de runderalvleesklier is een voorbeeld van RNase A. En het is een van de sterkste enzymen die in het laboratorium worden gebruikt. Dit enzym heeft geen cofactor nodig voor zijn activiteit. Het is een zeer thermostabiel enzym. RNase A is het eerste enzym en het derde eiwit waarin een correcte aminozuursequentie werd gedetecteerd. Dit enzym is erg klein met 124 aminozuren en een molecuulmassa van 12600da. En het heeft vier histidine-residuen (His 12 en His 119 die betrokken zijn bij katalytische reactie).
Figuur 01: De RNase A
RNase A kan worden geïsoleerd door een ruw monster te koken. Als het kookt, breken alle andere enzymen het resterende RNase A af. RNase A is een verbazingwekkend stabiel enzym. Dit enzym remt met ribonucleaseremmer-eiwit, zware metalen en uridinevanadaatcomplexen.
Wat is RNase H?
De RNase H is een niet-specifiek ribonuclease-enzym dat RNA in RNA-DNA-hybride via hydrolytische reactie kan afbreken. De RNase H splitst de 3'- de OP-binding van RNA in een RNA-DNA-hybride. Uiteindelijk produceert het 3'OH- en 5'-fosfaatbeëindigde producten. Bij DNA-replicatie speelt het een cruciale rol door de RNA-primer te verwijderen nadat nieuwe DNA-strengen zijn gevormd. In laboratoriumomstandigheden breekt het specifiek RNA af in RNA-DNA-hybride, maar niet in DNA en niet-gehybridiseerd RNA. En dit enzym wordt meestal gebruikt om de RNA-template te vernietigen nadat de eerste complementaire DNA-streng is gevormd tijdens cDNA-synthese.
Figuur 02: RNase H
RNase H gebruikt ook in nuclease-beschermingstesten. Het kan ook worden opgenomen bij het verwijderen van poly A-staart uit mRNA. RNase H heeft het vermogen om het niet-coderende RNA binnen en buiten de cel te vernietigen. De metaalionen zijn nodig als cofactoren voor deze eiwitactiviteit. Een chelator (EDTA) kan worden gebruikt om het RNase H-enzym te remmen.
Wat zijn de overeenkomsten tussen RNASE A en RNASE H?
- Beide zijn eiwit van aard.
- Beide zijn endoribonuclease
- Beide kunnen RNA afbreken.
- Beiden voeren hydrolytische reacties uit.
- Moleculaire laboratoria gebruiken beide.
Wat is het verschil tussen RNASE A en RNASE H?
Diff Artikel Midden voor Tafel
RNASE A versus RNASE H |
|
| RNase A is een pancreasribonuclease dat specifiek het 3'-uiteinde van ongepaarde cytosine- en uracilresiduen van enkelstrengs RNA splitst bij hogere zoutconcentraties. | RNase H is een niet-specifiek ribonuclease-enzym dat RNA in RNA-DNA-hybride via een hydrolytische reactie kan afbreken. |
| Aard van RNA-splitsing | |
| RNase A splitst specifiek enkelstrengs RNA bij hogere zoutconcentraties. | RNase H splitst RNA in RNA-DNA-hybride. |
| Behoefte aan co-factoren voor activiteit | |
| RNase A heeft geen cofactoren nodig voor zijn activiteit. | RNase H heeft metaalionen nodig als cofactoren voor zijn activiteit. |
| Remmers van eiwitactiviteit | |
| Ribonucleaseremmer-eiwit, zware metalen en uridinevanadaatcomplexen remmen de RNAse A-activiteit. | Een chelator (EDTA) remt de RNase H-activiteit. |
| RNA-primerverwijdering bij DNA-replicatie | |
| RNase A wordt niet gebruikt voor het verwijderen van RNA-primers bij DNA-replicatie. | RNase H wordt gebruikt voor het verwijderen van RNA-primers bij DNA-replicatie |
| Verwijdering van DNA-sjabloon in complementair DNA (C-DNA) -synthese | |
| RNase A wordt niet gebruikt voor het verwijderen van RNA-matrijzen tijdens complementaire DNA-synthese (C-DNA). | RNase H wordt gebruikt voor het verwijderen van RNA-matrijzen tijdens complementaire DNA-synthese (C-DNA). |
| Verwijdering van Poly-A-Tail in mRNA gehybridiseerd met Oligo (dt) | |
| RNase A wordt niet gebruikt om "poly-A-staart" te verwijderen in mRNA gehybridiseerd met oligo (dt). | RNase H wordt gebruikt om "poly-A-staart" te verwijderen in mRNA gehybridiseerd met oligo (dt) |
Samenvatting - RNASE A versus RNASE H
De ribonucleasen zijn nuclease-enzymen die het vermogen hebben om RNA in kleinere eenheden te splitsen. Er zijn twee soorten; endoribonucleasen en exoribonucleasen. Endoribonuclease is een endonuclease dat het vermogen heeft om enkelstrengs of dubbelstrengs RNA af te breken. En het splitst de fosfodiësterbinding binnen een RNA-polynucleotideketen. RNase A en RNase H zijn twee endoribonucleasen. RNase A is een pancreasribonuclease dat specifiek ongepaarde cytosine- en uracilresiduen splitst aan het 3'-uiteinde van het enkelstrengs RNA bij een hogere zoutconcentratie. RNase H is een niet-specifiek ribonuclease-enzym dat RNA in RNA-DNA-hybride via een hydrolytische reactie kan afbreken. Dit is het verschil tussen RNase A en RNase H.
Download de pdf RNASE A versus RNASE H
U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en voor offline doeleinden gebruiken volgens de citatienota. Download hier de pdf-versie. Verschil tussen RNASE A en RNASE H
