De belangrijk verschil tussen interspecifieke en intraspecifieke hybridisatie is dat interspecifieke hybridisatie plaatsvindt tussen twee verwante individuen die tot twee verschillende soorten behoren, terwijl de intraspecifieke hybridisatie plaatsvindt tussen genetisch divergerende twee individuen van dezelfde soort.
Hybridisatie is het proces van het paren of kruisen van genetisch gedifferentieerde individuen of groepen. Het belangrijkste doel van hybridisatie is het combineren van gewenste genen die aanwezig zijn in verschillende organismen. Bovendien wordt hybridisatie gebruikt bij het produceren van raszuivere nakomelingen. Het paren kan worden gedaan tussen twee individuen van dezelfde soort of tussen twee individuen van de verschillende soort. Op basis daarvan zijn er twee soorten hybridisatie: intraspecifieke hybridisatie en interspecifieke hybridisatie.