Het belangrijkste verschil tussen RQ en RER is dat RQ een directe meting is die uit het bloed wordt genomen en RER in een indirecte meting die door de ademhaling wordt genomen.
Calorimetrie meet de hoeveelheid warmte die vrijkomt bij het metabolisme of het energieverbruik. Metabolisme heeft zuurstof nodig en het produceert kooldioxide. Ademhalingsquotiënt (RQ) en Ademhalingsuitwisselingsverhouding (RER) zijn twee calorimetriemetingen die vergelijkbaar zijn. RQ is echter een directe meting uit het bloed. Het is de metabolische uitwisseling van gasverhouding die gelijk is aan CO 2 -productie ten opzichte van zuurstofopname (CO 2 / O 2). RER is een indirecte meting gemeten via de ademhaling. Daarom is RQ een invasieve methode, terwijl RER een niet-invasieve methode is.