Het belangrijkste verschil tussen ultrasoonapparaat en homogenisatie is dat ultrasoonapparaat een celdisruptietechniek is die geluidsenergie gebruikt om weefsels en cellen te verstoren, terwijl homogenisatie een celdisruptietechniek is die voornamelijk een fysieke kracht gebruikt om celmembranen te breken.
Om biomoleculen, hun reacties en andere celinhoud te analyseren, is het nodig om weefsels te ontwrichten om cellen vrij te maken en cellen te verstoren om hun inhoud vrij te geven. Er zijn verschillende cellysis-technieken. Sonificatie en homogenisatie zijn twee van dergelijke technieken. Sonicatie maakt gebruik van geluidsenergie of ultrasone golven om cellen te verstoren, terwijl homogenisatie mechanische kracht gebruikt om cellen te verstoren.