De belangrijk verschil tussen mutageen en teratogeen is dat mutageen een stof of een middel is dat een verandering in de sequentie van het DNA van een individu veroorzaakt, terwijl een teratogeen een middel is dat tijdens de zwangerschap schade toebrengt aan de foetus of het zich ontwikkelende embryo.
Mutagenen en teratogenen zijn meestal chemische agentia. Fysische en biologische agentia kunnen echter ook als mutageen of teratogeen werken. Beide kunnen bij individuen tot zeer schadelijke of dodelijke effecten leiden. De verbetering van de biotechnologie heeft echter nieuwe inzichten opgeleverd in zowel de concepten mutagene als teratogenen.
