Het belangrijkste verschil tussen amnion en allantois is dat amnion het binnenste dunne membraan is dat het zich ontwikkelende embryo of de foetus omgeeft en een hydrostatisch kussen vormt, terwijl allantois een verlenging is van de achterwand van de dooierzak en tussen het amnion en chorion ligt.
Een zich ontwikkelend embryo is omgeven door verschillende foetale membranen. Deze membranen beschermen het embryo tegen externe druk en beschadigingen. Amnion en allantois zijn twee membranen van de vier typen. In feite zijn het met vloeistof gevulde zakjes. Bovendien is de aanwezigheid van amnion en allantois een karakteristiek kenmerk van zoogdieren, vogels en reptielen.