De belangrijk verschil tussen capside en capsomeer is dat capside de eiwitmantel is die het virale genoom omringt en beschermt, terwijl capsomere de structurele subeenheid is van een virale capside en aggregatie van verschillende protomeren als een eenheid.
Virussen zijn intracellulaire parasieten. Ze zijn allemaal besmettelijk en veroorzaken verschillende soorten ziekten bij planten, dieren, protisten, bacteriën en schimmels. Er zijn twee hoofdcomponenten die een virus maken. Ze zijn de eiwitomhulling en het nucleïnezuurgenoom. Eiwitomhulsel, ook wel capside genoemd, bestaat uit eiwitten. De belangrijkste functie van de capside is om het virale genoom te beschermen en te helpen bij het infectieproces. Een capside bestaat uit capsomeren, de structurele en morfologische subeenheden van het virale capside. Capsomeren zelf assembleren mooi en geven vorm aan de virale capside in elk virusdeeltje. Structureel gezien is capsomeer een samenvoeging van verschillende protomeren als een eenheid.